大分銀行ビジネスダイレクトのデータ伝送サービスの登録追加・変更について、振込先はグループとして登録しておかなければいけないのですか？

グループとして登録する必要はありません。
グループは必要に応じて作成してください。なお、作成した場合に、どのグループにも属さない口座の指定や複数グループに属する口座の指定を行うことも可能です。